1. หน้าที่เกี่ยวกับการให้คำปรึกษา

1. เป็นที่ปรึกษาของผู้ว่าราชการจังหวัดเกี่ยวกับกิจการศาสนาอิสลามในจังหวัดนั้น ๆ
2. ประสานงานและให้คำปรึกษาแก่คณะกรรมการกลางอิสลามแห่งประเทศไทยในกิจการที่เกี่ยวข้องกับศาสนาอิสลาม

2. หน้าที่เกี่ยวกับการบริหารงานภายในองค์กร

1. กำกับดูแลและตรวจตราเอกสารการเงินและบัญชีทรัพย์สินของมัสยิด
2. พิจารณาวินิจฉัยและมีมติให้กรรมการอิสลามประจำมัสยิดพ้นจากตำแหน่ง หากมีความประพฤติเสื่อมเสีย บกพร่องต่อหน้าที่ หรือกระทำการที่ขัดต่อหลักศาสนา
3. แต่งตั้งกรรมการอิสลามประจำจังหวัดเพื่อจัดทำทะเบียนสัปปุรุษประจำมัสยิดในกรณีที่มัสยิดนั้นไม่มีคณะกรรมการหรือทะเบียนสูญหาย
4. พิจารณาวินิจฉัยการคัดค้านกรณีที่สัปปุรุษถูกจำหน่ายชื่อออกจากทะเบียน

3. หน้าที่เกี่ยวกับการรับรองและการส่งเสริม

1. เป็นหน่วยงานที่ตรวจสอบ ตรวจรับรอง และออกใบรับรอง "ฮาลาล" สำหรับผลิตภัณฑ์หรือบริการของผู้ประกอบการในจังหวัด
2. ส่งเสริมการศึกษาและจัดกิจกรรมที่ไม่ขัดต่อบทบัญญัติแห่งศาสนาอิสลาม
3. ดูแลสวัสดิภาพของเด็กกำพร้าและผู้ด้อยโอกาส

4. หน้าที่เกี่ยวกับศาสนกิจ

1. แจ้งผลการดูดวงจันทร์ต่อคณะกรรมการกลางอิสลามแห่งประเทศไทย เพื่อกำหนดวันสำคัญทางศาสนา เช่น วันเริ่มต้นเดือนรอมฎอน (เดือนถือศีลอด)